Qui sommes-nous ?
IBC est une société innovante basée en France.
Notre cœur de métier et notre technologie brevetée sont à la convergence de la modélisation multi-échelle des systèmes biologiques, de l’intelligence artificielle, de l’apprentissage automatique, et des Technologies de l’Information et de la Communication (TIC).
Nous sommes également spécialisés dans la réalisation de serious games (jeux sérieux) et de ressources éducatives incluant animations, modèles, simulateurs et objets graphiques et scènes 3D.
IBC a reçu de nombreux prix et soutiens financiers aux niveaux régional et national, dans la biologie computationnelle, l’aide à la décision, et les serious games dédiés aux sciences et à la formation.
Notre vision
Avec l’avènement d’Internet-2 qui va permettre à la réalité virtuelle d’entrer dans chaque foyer, nous pensons donc que le moment est venu de créer des systèmes immersifs de pointe pour la formation, l’aide à la décision et la recherche. La formation, initiale et continue, intégrée dans des environnements virtuels va se généraliser tant dans les pays industrialisés que dans les pays en voie de développement. De même, l’apprentissage par la pratique et l’expérimentation in virtuo utilisant des simulateurs vont devenir monnaie courante. Les Jeux Sérieux combineront agents intelligents possédant de réelles compétences pour la résolution de problèmes avec des simulateurs dynamiques multi-échelles des systèmes étudiés. Ils constitueront le fer de lance de cette nouvelle approche à la formation dans le monde entier. Moyennant des environnements technologiques appropriés, il sera possible de faire évoluer ces jeux sérieux vers des Systèmes d’Aide à la Décision et des systèmes intelligents dédiés à la R&D.
Notre contribution
Nous savons par expérience que l’un des principaux obstacles au développement de systèmes informatiques avancés dans des domaines complexes est d’établir des ponts entre les différents spécialistes qui participent à un projet commun. Cela peut inclure des développeurs de logiciels, des mathématiciens appliqués, des scientifiques, des ingénieurs et des médecins. Notre technologie est issue d’une longue histoire de pilotage/coordination de projets multidisciplinaires et multicentriques avec des centres de recherche français et européens (CNRS, INSERM, etc.). En apportant notre technologie pour le développement de produits, nous apporteront également nos compétences transdisciplinaires afin de participer à la coordination de partenariats académiques et industriels issus de différents domaines, pour le bénéfice de toutes les parties prenantes et des utilisateurs finaux.
Nous collaborons avec des partenaires académiques :
Rapports & Publications Internationaux
Projet Européen: Intelligent Monitoring System
- SIREGAR P., COATRIEUX J.L., LE BEUX P., Report on existing knowledge representation. KISS, European AIM Program, A1006-1.2.A.F.R-890717, 80 pages, Oct. 1989.
- MABO P., COATRIEUX J.L., SIREGAR P., Report on the definition of the evaluation domain., KISS, European AIM Program, A1006-2.1.A.F.R-890915, 12 pages, Nov. 1989.
- SIREGAR P., LE MOULEC F., DI RIENZO M., Initial report on knowledge representation and reasoning methods, KISS, European AIM Program, A1006-1.2.A.F.R-900321, 65 pages, March 1990.
- SIREGAR P., DI RIENZO M., Final report on knowledge representation and reasoning methods, KISS, European AIM Program, A1006-1.2.A.F.R-900930, 120 pages, Sept. 1990.
- SIREGAR P., SCHIPPERS J., Framework: Version 1, Initial reference model. KISS, European AIM Program, A1006-2.2.A-V-F-901109, 72 pages, Jan. 1990.
- SIREGAR P., SCHIPPERS J., COATRIEUX J.L. Framework: Version 2, Final reference model. KISS, European AIM Program, A1006-2.2.A-F-V-901130, 70 pages, Nov. 1990.
- FERREIRA P.J., GUEDES DE OLIVIERA P., OLIVEIRA E SILVA T., GARNER B.P., DA LUZ VIEIRA J., LE MOULEC F., SIREGAR P., Final evaluation results. KISS, European AIM Program, A1006-3.3.B-F-B-901130, 40 pages, Nov. 1990.
- SIREGAR P., VAN RIET R., SCHIPPERS J., BALOCCHI R., GARNER B.P., GUEDES DE OLIVIERA P., DI RIENZO M.: KISS: Knowledge Based Intelligent Signal monitoring System. A.I.M. Euroforum, Seville, Spain, pp 320-327, 1990.
Immunologie, biologie cellulaire et moléculaire
- DAVEAU M., DAVRINCHE C., JULEN N., HIRON M., ARNAUD P. and LEBRETON J.P., The synthesis of alpha-2-HS glycoprotein is down-regulated by cytokines in hepatoma HepG2 cells, FEBS Lett., 241: 191-194, 1988.
- RIPOCHE J., DEMARES M.J., JULEN N., LEMERCIER C., DAUCHEL H., DAVRINCHE C., DAVEAU M. and FONTAINE M., Les protéines régulatrices du système du complément, Médecine/sciences, 5: 234-243, 1989.
- DAUCHEL H., JULEN N., LEMERCIER C., DAVEAU M., OZANNE D., FONTAINE M. and RIPOCHE J., Expression of complement alternative pathway proteins by endothelial cells. Differential regulation by interleukin-1 and glucocorticoids, Eur. J. Immunol., 20: 1669-1675, 1990.
- JULEN N., DAUCHEL H., LEMERCIER C., DAVEAU M., FONTAINE M., SAUGER F., MAITROT B. and RIPOCHE J., L’exploration du système du complément. Principes généraux et perspectives, Ann. Biol. Clin.,48: 349-360, 1990.
- DAVEAU M., DAVRINCHE C., DJELASSI N., LEMETAYER J., JULEN N., HIRON M., ARNAUD P. and LEBRETON J.P., Partial hepatectomy and mediators of inflammation decrease the expression of liver alpha-2-HS glycoprotein gene in rats, FEBS Lett., 273: 79-81, 1990.
- JULEN N., DAUCHEL H., LEMERCIER C., SIM R.B., FONTAINE M. and RIPOCHE J., In vitro biosynthesis of complement factor I by human endothelial cells, Eur. J. Immunol., 22: 213-217, 1992.
- LEMERCIER C., JULEN N., COULPIER M., DAUCHEL H., OZANNE D., FONTAINE M. and RIPOCHE J., Differential modulation by glucocorticoids of alternative complement protein secretion in cells of the monocyte/macrophage lineage, Eur. J. Immunol., 22: 909-915, 1992.
- JULEN N., DAVRINCHE C., OZANNE D., LEBRETON J.-P., FONTAINE M., RIPOCHE J. and DAVEAU M., Differential modulation of complement factor H and C3 expression by TNF-alpha in the rat. In vitro and in vivo studies, Molec. Immunol., 29: 983-988, 1992.
- GASQUE P., JULEN N., ISCHENKO A.M., PICOT C., MAUGER C., CHAUZY C., RIPOCHE J. and FONTAINE M., Expression of complement components of the alternative pathway by glioma cell lines, J. Immunol., 149: 1381-1387, 1992.
- ERDEI A., JULEN N., MARSCHANG P., FEIFEL E., KEREKES K. and DIERICH M.P., A novel, complement factor H-related regulatory protein expressed on the surface of human B-cell lines, Eur. J. Immunol., 24: 867-872, 1994.
- JULEN N., JANATOVA J., MUR E., WENT P., RIPOCHE J. and DIERICH M.P., Degradation of complement component C3 in joint fluid from rheumatoid arthritis patients is reduced by cathepsin G and consecutive factors H and I of the complement system,Int. J. Immunopathol. Pharmacol., 7: 7-20, 1994.
- LARCHER C., JULEN N., PRODINGER W.M., TOETSCH M., GUERTLER L. and DIERICH M.P., Reduced CD21 (CR2) and CD54 (ICAM-1) expression in MT2 cells with HIV-1 or HIV-2 strains, Immunology Letters, 31-36, 1995.
Modélisation multi-échelle quantitative et qualitative
- SIREGAR P. Concept discovery in qualitative biophysics: A primer for quantitative biophysics, 1st European Conf. onCellular Engineering, Nice, France, 1991.
- SIREGAR P., LE MOULEC F.: Modeling the heart’s electrical activity: a qualitative-analog approach. Proc. IEEE Eng. in Medicine and Biology Soc. (EMBS 91), Orlando, pp 1052-1053, 1991.
- SIREGAR P., CHAHINE M., LEMOULEC F., LE BEUX P. An Interactive Qualitative Model in Cardiology, Comput Biomed Res, Vol. 28, 443-478, 1995.
- SIREGAR P., Theoretical Cardiology: From Mathematical to Qualitative Models. J. Biol. Sys., Vol 4, 131-150, 1996.
- SIREGAR P., SINTEFF J.P, CHAHINE M., LE BEUX P., A Cellular Automata of the Heart and its coupling with a Qualitative Model, Comput Biomed Res, Vol 29, N03, 222-246, 1996.
- SIREGAR P., SINTEFF J.P., JULEN N., LE BEUX P., An interactive 3D anisotropic cellular automata model of the heart,Comput. Biomed. Res., Vol. 31, 323-347, 1998.
- BIGOIN T., SIREGAR P., SINTEFF J.P., JULEN N., LE BEUX P., LESSARD Y., Mechanism of ventricular arrhythmias in the hypertrophied heart of rats : 3D computational model assessment, Arch. Mal. Coeur et Vaisseaux, 94, 4 : 365, 2001.
- SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., Computational Integrative Physiology: At the Convergence of the Life, Physical and Computational Sciences. Proceedings of the Dec 14th 2001 meeting of the European Commission on ‘Synergy between Research in Medical-Informatics, Bio-informatics and Neuro-Informatics’, Brussels, 2002.
- SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., Computational Integrative Physiology: At the Convergence of the Life, Physical and Computational Sciences, Methods of Information in Medicine, 42:177-84, 2003.
- SIMEONOV P.L., BREZINA, E., COTTAM, EHRESMANN, A. C., GARE, A., GORANSON, T., GOMEZ-RAMIREZ, J., JOSEPHSON, B. D., MARCHAL, B., MATSUNO, K., ROOT-BERNSTEIN, R. S., RÖSSLER, O. E., SALTHE, SCHROEDER, M., S. N., SEAMAN, B., SIREGAR P., SMITH, L. S. Stepping Beyond the Newtonian Paradigm in Biology. Towards an Integrable Computational Model of Life: Accelerating Discovery in the Biological Foundations of Science. INBIOSA White Paper. In: Integral Biomathics: Tracing the Road to Reality, P. L. Simeonov, L. S. Smith, A. C. Ehresmann (Eds.), Springer-Verlag, Heidelberg, ISBN-10: 3642281109; ISBN-13: 978-3642281105, 2012.
- SIMEONOV P.L., GOMEZ-RAMIREZ J., SIREGAR P., On some recent insights in Integral Biomathics, ProgBiophys Mol Biol. 2013 Sep;113(1):216-28.
Calcul parallèle et simulation
- CAUX J., SIREGAR P., HILL D., « Accelerating 3D Cellular automata computation with GP GPU in the context of multiscale integrative biology », Chapter 20 in Cellular Automata – Innovative Modelling for Science and Engineering, Alejandro Salcido Ed., ISBN: 978-953-307-172-5, InTech, 2011, pp. 411-426.
- PASSERAT-PALMBACH J., CAUX J., SIREGAR P., MAZEL C., HILL D., « Warp-Level Parallelism : Enabling Multiple Replications in Parallel on GPU », Proceding of the 2011 EuroPean Simulation and Modelling Conference, Oct. 24-24, Guimarães, Portugal, pp. 76-83, Best paper award.
- CAUX J., SIREGAR P., HILL D., “Hash Life algorithm on 3D excitable medium Application to Integrative Biology”, ACM SIGSIM/SCS Summer Computer Simulation Conference, 11-1 July, 2010, Ottawa Canada, pp. 387-393.
- CAUX J., HILL D. and SIREGAR P., « Accelerating 3D Cellular automata computation with GP-GPU in the context of integrative biology », In Research Report LIMOS/RR-10-10, April 2010, HAL Id: hal-00679045.
- PASSERAT-PALMBACH J., SCHWEITZER P., CAUX J., SIREGAR P., MAZEL C., HILL D., Harnessing Aspect Oriented Programming on GPU: Application to Warp-Level Parallelism (WLP) , International Journal of Computer Aided Engineering and Technology, 2015, 7 (2), pp.158-175
Chimie computationnelle
- BENKAIDALI L., ANDRE F., MAOUCHE B, SIREGAR P., BENYETTOU M., MAUREL F., PETITJEAN M. Computing cavities, channels, pores and pockets in proteins from non-spherical ligands models, Bioinformatics, 2014 Mar 15;30(6):792-800.
Intelligence artificielle et modélisation
- SIREGAR P., Le MOULEC F., SCHIPPERS J., MABO P., SEVERI S.: Shallow and deep knowledge in coronary care unit. 1st European Conf. on Biomedical Engineering, Nice, pp 231-232, 1991.
- SIREGAR P., TOULOUSE P.: Model-based Diagnosis of Brain Disorders: A Prototype Framework, Artificial Intelligence in Medicine, 7: 315-342, 1995.
- SIREGAR P., SINTEFF J.P., Introducing Spatio-temporal reasoning into the inverse problem in electroencephalography, Artificial Intelligence in Medicine, vol 8, 97-122, 1996.
- SIREGAR P., SINTEFF J.P., JULEN N., LE BEUX P., Spatio-Temporal Reasoning For Multi-scale Modeling in Cardiology, Special Issue on Cardiovascular Systems, Artificial Intelligence in Medicine, Vol. 10, 41-57, 1997.
Ontologies, aide à la décisionet dispositifs médicaux intelligents
- CARRAULT G., KIANI H., GARREAU M., SIREGAR P., COATRIEUX J.-L., « SESAME: Système Expert Signal Analyse de données en Myographie », Innov. Tech. Biol. Med., 8(2):121-133, 1987.
- GARREAU M., BELLANGER J.J., COATRIEUX J.-L., SIREGAR P.: Décomposition du signal électromyographique par une approche intelligence artificielle. Special Issue on Expert Systems in Medicine, J.L. Coatrieux Ed., Innov. Tech. Biol. Med., 8(2):133-137, 1987.
- SIREGAR P., TOULOUSE P., CARRAULT G., LE NOACH R., COATRIEUX J.-L.: Localization of epileptogenic process: a simulation study. Proc. IEEE EMBS, New-Orleans, pp 1448-1449, 1988.
- SIREGAR P., LE NOACH R., SCARABIN J.-M., COATRIEUX J.-L, Problème inverse et stabilité en électroencéphalographie. Innov. Tech. Biol. Med., 10(6):643-658, 1989.
- SIREGAR P., MABO P., COATRIEUX J.L., How can deep knowledge be used in CCU Monitoring? Special Issue on Intelligent Monitoring Systems, IEEE Eng. Med. Biol., Vol. 4, N0 12, 92-99, 1993.
Technologies de l’information et Formation
- SIREGAR P., CHAHINE M., SINTEFF J.P. and LE BEUX P., Deep knowledge and Computer-Assisted Instruction in Cardiology. Proc. 8th World Congress on Medical Informatics, MEDINFO 95, Vancouver, Canada, 1237-1240, 1995.
- JULEN N., SIREGAR P., SINTEFF J.P., LE BEUX P., A qualitative model for Computed-Assisted Instruction in Cardiology, AMIA, Orlando, 1998.
- BURGUN A., LE DUFF F., FRESNEL A., SIREGAR P., JULEN N., GROBOIS B., EDAN G., GUILLE F., LE BEUX P., Vers l’intégration des NTIC dans une approche pédagogique par problème en médecine. Informatique et Santé, 2000, 12, 185-194.
- LESSARD Y., SINTEFF J.P., JULEN N., LE BEUX P., SIREGAR P., Dynamic simulations with a 3D computational model of heart for teaching physiology and cardiology. Eur J Physiol, 442, 5 : R89, 2001.
- LESSARD Y., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., SIREGAR P., Dynamic simulations with a 3D computational model of heart for teaching pharmacology. 6th Joint meeting of Société Française de Pharmacologie (SFP) and Pharmacological Societies of Brazil and Portugal, Rennes, 2002.
- LESSARD Y., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., SIREGAR P., Dynamic simulations with a 3D computational model of heart for teaching physiology and cardiology. 70th annual meeting Société de Physiologie, Quebec, Canada, 2002.
- SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LESSARD Y., Medical Advisor, un professeur virtuel dédié à l’approche pédagogique par problèmes, IPM 2003, 2ème séminaire international Internet et Pédagogie Médicale, 2003.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., Création et développement d’un campus numérique de Physiologie, IPM 2004, 3ème séminaire international Internet et Pédagogie Médicale, 2004.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., Nouveaux modes d’acquisition des connaissances médicales : le Campus Numérique de Physiologie, IPM 2005, 4ème séminaire international Internet et Pédagogie Médicale, Rennes, 1-2 décembre 2005.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., Campus Numérique de Physiologie : learning from multimedia, P2T 2006, 1er congrès commun de Physiologie, Pharmacologie et Thérapeutique, Montpellier, 10-12 avril 2006. Fundam. Clin. Pharmacol. 2006, 20 : 53.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., Des ressources multimédia pour l’enseignement de la physiologie, CIUEN 2006, Colloque International Université à l’Ere du Numérique, Paris, 22-24 mai 2006.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., Multimedia and physiology: a new way to ensure the quality of medical education and medical knowledge. MIE 2006, Maastricht, The Netherlands, August 27-30 2006. Stud Health Technol Inform 124: 899-904, 2006.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., HANNOUCHE F., RIO S., An ECG analysis interactive training system for understanding arrhythmias In Studies in Health Technology and Informatics (Proceedings of MIE 2009 Sarajevo), 150:931-935, 2009.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., Computer simulation and medical education: complementary tools for the third millennium, MEDINFO 2007, Brisbane, Australia.
- LESSARD Y., SIREGAR P., JULEN N., SINTEFF J.P., LE BEUX P., HANNOUCHE F., RIO S., An ECG analysis interactive training system for understanding arrhythmias. XXII International conference of the European Federation for Medical Informatics (MIE 2009) Sarajevo, Aug. 30. – Sept. 2. 2009.